Pfersee ist eine Gründung aus der Römerzeit (Funde im Römischen Museum in Augsburg), ist seit 1911 nach Augsburg eingemeindet. Bereits 13 Jahre zuvor wurde Pfersee über eine Straßenbahnbahnlinie mit der Innenstadt verbunden. Bereits 1905 zählte der Ort 8.589 Einwohner. Dort gab es schon damals zahlreiche Industrieansiedlungen . Heute hat Pfersee ca. 20.000 Einwohner.
Erstmals schriftlich genannt wird der Ort 1126. Er hatte eine Burg und eine Kirche. Im folgenden wechselten die Besitzer von Dorf und Burg häufig. 1682 gelangt Pfersee in den Besitz des Augsburger Bischhofs. Seit 1881 verkehrte eine Pferdebahn in die Innenstadt. Vor und während des 2. Weltkrieges gab es in der Flag-Kaserne ein Außenlager des KZ.s von Dachau.
Ende der 1960er Jahre setzte der Umbau von der Industrie zur Wohnstadt ein. Der Trend setzt sich bis heute fort.
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